La crisi dei missili cubani volge al termine quando la leader sovietica Nikita Krusciov accetta di rimuovere i missili russi da Cuba in cambio di una promessa degli Stati Uniti di rispettare la sovranità territoriale di Cuba. Ciò concluse quasi due settimane di ansia e tensioni tra gli Stati Uniti e l'Unione Sovietica che si avvicinavano a provocare un conflitto nucleare. Le conseguenze della crisi furono molte e varie. Le relazioni tra Cuba e l'Unione Sovietica furono sospese per qualche tempo dopo la rimozione dei missili da parte di Krusciov, mentre Fidel Castro accusava i russi di arretrare dagli americani e abbandonare la rivoluzione cubana. Anche gli alleati europei degli Stati Uniti erano arrabbiati, non a causa della posizione degli Stati Uniti durante la crisi, ma perché l'amministrazione Kennedy li teneva praticamente al buio per i negoziati che avrebbero potuto portare a una guerra atomica.

All'interno dell'Unione Sovietica, i sostenitori della linea dura furono sconvolti dal ritiro delle armi da parte di Kruscev. Due anni dopo, nel 1964, Leonid Brezhnev e Aleksei Kosygin lo spinsero dal potere e presero a guidare l'Unione Sovietica su un massiccio accumulo militare. C'è stato forse un aspetto positivo della crisi. Essendo andato al limite di quello che il presidente Kennedy chiamava "l'abisso della distruzione", i capi più freddi di entrambe le nazioni iniziarono i passi per iniziare un controllo sulle armi nucleari. Meno di un anno dopo la fine della crisi, gli Stati Uniti e l'Unione Sovietica hanno firmato un accordo per porre fine ai test fuori terra; nel 1968, entrambe le nazioni firmarono un trattato di non proliferazione.